“夜，冴子，我培育出了新的美味哦！”静香老师手中拿着一直奇怪的鸟。
数码宝贝世界的真神是伊古拉西德尔，也就是俗称的世界树，它的真实身份是现实世界八十年代诞生的网络所寄宿的超级计算机，也就是说，整个数码宝贝世界本身便寄宿在世界树体内。而这个世界，世界树所在的计算机，最初的功能是R社（火箭队）为了记录“人物卡片”“怪兽卡片”“口袋妖怪”的数据的总和图鉴而制造出来的。
随着时间的流逝，伊古拉西德尔由于本体老旧而面临淘汰，拥有自己意志的它在网络中制造了名为现在层的世界，并企图将自己的意志转移到现在层，而后以某种病毒（X程序）企图摧毁过去层的所有数码兽。简单的比喻，也就是因为自己家要被断水断电甚至强拆，为了活下去他企图“删库跑路”。
而这个过程中，为了保护自身的意志，而诞生出了名为皇家骑士的数码兽团体。然而，过去层的数码兽在灭世病毒的侵袭下却没有完全灭绝，其中极少的一部分获得了名为x抗体的力量，并进入了现在层，于是发生了剧场版《第十三名皇家骑士》的故事，然而还不等世界树与奥米加兽X打起来，一位龙属性训练家用三D龙搞定了，暴走的世界树被认为是变异为智能生命的人工智能。
也就是数据库被灭世病毒清洗一遍，但是数据又从世界树那里拿了回来核心数据的备份。被灭世病毒清洗了一遍的过去层也重新诞生了数码兽，但是由于经历了一轮大毁灭，过去层的平均力量很低，究极体加起来也没有几只，但却能够找到各种超规格的遗迹。
过去层所在的超级计算机原本的意志离开了，但是数码界这个之前没有被认知到的次元进入了人们的视野，而相比于莫测的阴间精灵界与现实成长缓慢的口袋妖怪，数码界的数码兽成为了一个不错的新卡片素材区。也就是恒常性还没有诞生就宣告了GG。
当然，为了更好的取材，现实世界接管后数码界后，并没有直接介入数码宝贝世界的管理，仅仅是开始有意识的录入各种珍惜物种的数据。
于是，斗争获胜的数码宝贝们开始自我管理这个世界。
兽类数码宝贝的代表四圣兽接管大陆，人型数码宝贝六翅兽管理人形世界天空。
因为争夺生存权，人兽大战爆发，人类获胜，六翅兽封印了黄龙兽开始统治数码世界，册封究级天使兽、神圣天女兽和基路比兽三位协助管理世界。
但是，六翅兽随着世界推移开始堕落，引发了十斗士的反叛，苦战之后，六翅兽被封印，三大天使接管世界。
但是，三大天使间的狗血三角恋引发了动乱，陆地上的四圣兽也各自为战内乱不止，神圣天女受召唤十斗士之魂平定了基路比兽，但数码世界陷入一片动乱中，黑暗势力全面入侵。
黑暗之王启示录兽怂恿黑暗四天王封印了四圣兽统治陆地，黑化的基露比兽统治天空。为了避免数码兽大灭绝，导致现实许多卡片后续开发无路，现实的人开始机械神降，黑暗势力顽固不化的直接被蒸发，剩下的被转化为新物种，缓慢调控新生态的形成。
同时，动荡阶段因为一只古代种的滚球兽误入现实，并在八神光（也就是嘉儿）的作用下急速进化，这引起了R社的注意，将这只规格外的暴龙兽抓了回来。
而在回归后，R社将再次进化的机械暴龙兽拆解分析，最后研究出了通过人类孩子的情绪促使数码兽进化的方法，也就是后来的神圣计划和徽章，但是这只机械暴龙兽就变成了尸体。
数码世界的时间比例是越来越慢的，数码世界本身的历史，按照不同的时间流速分为四个阶段--史前、超古代、古代和现代。
史前就是数码死神存在的时候，那个时代甚至连完全体都不多，后来以世界树以X程序灭世为终结，超古代则是各种究极体争霸天下，四大龙、四圣兽等兽型数码兽居于顶峰，
而后爆发了人形数码兽与兽型数码兽的战争，天赐之子光明兽诞生，建立神之队列，镇压四圣兽，平息纷争，象征着超古代的结束，而后就是古代，光明兽暴力统治，十斗士联手封印。最后则是现代。
超古代的时间比是一秒钟等于数码世界一天，古代是十秒等于数码世界一天，现代是一分钟等于数码世界一天，至于原因，除了数码界的数据越来越多，运行占据资源越来越多，版本大大迭代的速度越来越慢，也有现实为了避免黑暗动荡发现缓慢，控制的较为迟缓的原因。
而静香的数码之旅，自然不会是什么“被选召的孩子”，而是数码暴龙机持有者。
或许是静香的天然呆让世界对于静香的年龄判断出现了一些误差，身份安排是刚刚大学的花季少女，进入数码世界主要是挑选第一个数码蛋。
但是，在创始村，也就是数码宝贝世界的最里层，最早出现的最初的那一层，现在作为现实世界前哨站的核心科研所，静香寻思这个世界和白夜给自己开发的培育屋挺像的，而后单线程的她在有了“属于自己的蛋”之后，就下意识开始培育起新食材。
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